我认为原因如下。灰原哀是工藤新一成为柯南后与柯南关系最密切的女主角之一。在戏剧版的《名侦探柯南》中，灰原哀曾经对柯南说:“如果是我，我宁愿失去记忆，这样我就可以忘记一切。我姐姐被杀了，我成了制造毒药的组织的成员。如果所有这些都可以忘记，做一个简单的学生灰原哀就好了。然后，我可以永远和你在一起...永远像这样……”这样的话等于含蓄的忏悔。但是这样的灰原哀，让很多人认为这是黑组织的卧底。
虽然灰原哀最初是黑衣人组织的成员，但灰原哀的父亲宫野厚司、母亲宫野艾莲娜和姐姐宫野明美都因黑衣人组织而死亡。灰原哀和黑衣人组织之间有着深深的仇恨！如果灰原哀真的要做卧底，那么她就放弃了父母和姐姐的仇恨。黑衣人组织能给灰原哀什么？让灰原哀这么努力工作？这是完全不可能的！
那些认为灰原哀是黑衣人组织的卧底的人有一个非常重要的原因，那就是他们认为青山需要给柯南一个大转弯。如果陪同柯南的宫野志保是一名卧底，那么这个转折是非常大的！但是这种转折点真的有必要吗？事实上，情况并非如此，因为这样的转折点太不合逻辑了，《柯南侦探》虽然有很多“柯雪”，但在主线上还是要符合逻辑的。如果灰原哀是黑衣人组织的卧底，不管她和黑衣人组织有什么血仇，灰原哀是如何隐藏自己的身份的？
灰原哀被日本最聪明的人包围着。工藤新一和服部平次侦探是全世界的高中侦探，更不用说总是出现在柯南身边的警察局警察了。此外，联邦调查局也非常了解灰原哀。所有这些人都是善良和邪恶的。如果灰原哀真的是黑衣人组织的卧底，那么她必须躲着这些人，同时还要隐藏1000多集和许多戏剧版本，这真的很难做到，所以我觉得这就是原因。