历史上的秦国，他们的君主是姓赵的。或者说是以赵为氏，因为他们还有一个古姓“嬴”，赵氏其实是嬴姓的一个主要支派，所以可以说秦始皇姓嬴也可以说他姓赵，都不错。但要说秦始皇姓秦那就是笑话了，正如说唐太宗姓唐，宋太祖姓宋，元太祖姓元一样扯淡。
一国的君主，一般不会发生姓氏与国号相同的情况，此种情况唯有南朝的陈朝发生过。至于春秋战国时的以国为氏，那只是该国被灭后，公室的子孙才会将以前的国号用做自己的氏。当这个诸侯国还存在的时候其君主是不用氏的，所以不存在君主以国为氏的道理。何况秦国君主在立国前就已经有氏了，更不需要用国号当做自己的氏，只有当秦朝垮台后，一些皇族遗贵才会把自己的氏改成“秦”。即使如此，现代的秦姓也不是秦始皇的后代，因为中国的秦姓主流其实是源于西周时期鲁国的一个公室支系，而源自秦国的秦氏比他们晚了几百年，地位也低得多，人数也少得多。秦始皇自己的儿女在宫廷斗争中全部死了，没有后代流传，所以现代的秦姓最多只能算秦始皇的一个支系亲戚。