2.人物服装略有变化。比如动画里主席的头饰只有两个蝴蝶结，漫画里只有四个。
3.漫画里还有覆盆子隐藏的力量。虽然苍星石在漫画中被水和水所害，漫画后部分复活，但可惜了雪华绮晶...
4.苍星石媒体的姓氏不同。
5.在漫画中，似乎玫瑰少女并没有复活，但动画的最终结局却是所有被蔷薇水晶打败的人都复活了。因为苍星石是被水银灯打败的，所以属于正规的爱丽丝游戏，而覆盆子是因为力量不足而虚弱，蔷薇水晶是个伪玫瑰少女。最后，拉普拉斯拥有了他们两人的罗莎之谜。
6.漫画里有个梅刚老师，是个纯粹的老师。动画里有一个玩偶店老板白起，好像是拉普拉斯魔变的人。