因为当时少帝刘辩的母亲是何皇后，这个女人可不简单，并且当时刘协是自小在董太后身边长大，他的生母也被何太后迫害死了，所以当时立刘协为帝，对董卓来说更好控制，所以他才会废掉刘辨而另立刘协为新帝。
少帝刘辩的生母是何皇后，当时汉灵帝在世的时候，这个何皇后便在他的后宫中兴风作浪，刘协的生母便是何皇后害死的，当时为了保住刘协的小命，董太后便将刘协养在自己的宫中，刘协因此才能健康长大。汉灵帝死后，何皇后的儿子刘辩便登基为帝，何皇后便临朝听政把持朝政。这个何皇后不是一个有才能之人，所以她临朝期间朝政非常混乱，这个时候，董卓便看到了自己成为权臣的希望，于是便进京之后废掉刘辩。
董卓要做权臣就得过得了何皇后这一关，何皇后不是一个愿意放权的人，所以董卓想要做权臣就只能先把何皇后解决。如果董卓与何皇后联盟的话，何皇后不一定能看得上董卓，就算勉强合作也不会完全信任董卓，而且这个何皇后做了这么多年的皇后，在朝堂以至于后宫中都有些势力，并且这个何皇后是一个比较有手段之人，所以解决何皇后最好的办法便是废掉少帝刘辩的帝位。
当时刘辩才15岁，而刘协才9岁，再加上刘协是自小在董太后的宫中长大，董太后与董卓是同族，并且这刘协的生母也不在了，董卓不用担心又有太后出来临朝听政，所以当时只有9岁的刘协对董卓来说，非常适合作为傀儡，所以他便废掉了刘辩。