除了大量恶搞之外，银魂漫画的另一个不同之处在于，如今的漫画有200多字，动画有100多字。《银魂》整个故事还是缺少一条清晰的故事线。主要人物印石以“石湾之家”为名整日吃喝，故事主要以描述其日常生活的单元情节为主。无论动画还是漫画，都是由一集或者几集组成，没有一个动人的故事线。《银魂》中是否有主线故事，如果有，故事未来如何发展，将是我们今天要讨论的话题。
少年跳楼漫画横向对比
-关于主角的心路历程
少年漫画中所谓的故事线，一般是指故事中主角的冒险旅程。这个旅程可能是缓慢的，也可能是曲折的，但它必须有一个方向，那就是前进。纵观《少年JUMP》中出现的少年漫画，每一部都有自己的故事线。无论是路飞在《海贼王》中寻找海贼王的冒险，还是鸣人向鸣人的目标迈进的一步，都有明确的方向，所以我们可以说这两部漫画都有一条故事主线。当然，这种“向前”的方向性在不同的动画作品中是无法表现出来的。具体来说有三种:一种是空间方位上的前进方向，这是最明确的“前进”。比如《海贼王》中，草帽海贼团正在走向大海峡的尽头；再有就是主角自身能力的提升，这也代表了主角实力的一种“进步”，代表了圣斗士中的青铜五小强人不断从第七感觉升级到第八感觉，直至最终达到神的境界的过程；最后一种是朝着某个目标不断前进(这其实是第一种形式的衍生)。比如在不久前刚刚结束的漫画《犬夜叉》中，虽然主角一行人的行踪被限制在了食骨井附近，无法在空间上移动太远，主角一行人的实力除了犬夜叉的刀之外也没有大的提升，但是他们却在不断的收集四魂之玉，并以杀死奈落为目标，而朝着这个目标前进的就是犬夜叉。
对比上述动画可以发现，至少现在的银魂不具备三种表现形式中的任何一种:“吴”总是在歌舞伎町和江户徘徊，说他们有一个前进的方向是绝对不可能的；从目前来看，三位选手的战力都不会提升(其实空知英秋一句话除了草原洞爷湖没有正面描述几个人的战力)；至于万万五想达到的具体目标，至少从现在整天游手好闲的懒人来看，完全看不出来。那么，银魂里真的没有故事主线的可能吗？
我们不要过早下结论。再来看另一部漫画《流氓剑心》，当年在青春跳跃上红极一时。虽然两部作品风格不同，但是流氓剑心在其他方面和银魂很像。首先是故事背景，以幕末到明治维新的日本为背景。当然复辟的概念并没有出现在《银魂》里，因为那是架空的历史，而是天人打开了幕府的大门。其次，两位主角的活动基本局限在京都的新谷道场附近(后来因为智志雄事件，他曾经在江户)，印石基本只在江户的歌舞伎町一带活动，所以《浪子印记》不属于像《银魂》那样的冒险类少年漫画。再次是主人公，马克曾经是改革派中令人闻风丧胆的“刽子手”，后来选择了浪人的生活，使用了尖刀；巧合的是，在忙于接待外国人的人群中，银魂一度是“白夜叉”的代名词。后来他也放弃了这个身份，戴上了一把名为“东野湖”的木刀，过上了平静的生活。这两位主角一出现在漫画中就已经具备了相当高的战斗力，所以后期几乎不需要提升战斗力(马克后来因为打败了志志雄真实而向师傅学习了九头龙闪和天香龙闪，但这与其他少年漫画中主角的战斗力突然有了质的飞跃不同)。更别说其他两部动画里的主角，都和新(真)选团，朝廷粉丝，还有忙着洋人的人有着千丝万缕的联系。单从以上三点来看，可以说这两部作品的整体背景基调是相似的。显然，流氓剑心是有主情节的，从最初的短篇到司乃森的宫廷文章数不胜数，再到后来的志志雄真实文章，最后到雪代的命运。流氓剑心的整个故事线，就是剑心通过守护所爱的人，逐渐摆脱曾经的“刽子手”在他心中留下的阴霾，最终获得自我救赎的全过程。在《银魂》中，虽然印石目前似乎没有明确的目标，但他也有黑暗的过去和珍惜的现在。在几百个故事中，我们可以知道他不止一次说过“保护身边的人”是他现在最大的愿望。