其实转基因过程有点脏，但是转基因植物经过自然生长还是相对干净的。
专家和大多数人担心的转基因食品的安全问题主要是，转入基因的稳定性。
转基因就必须使用“工具”，常见的工具主要是细菌和病毒，显示好的优良基因大多是保存在大肠杆菌和农杆菌中的，菌中有一种独立的DNA片段即质粒，环形质粒上保存了目的基因。菌液加入甘油后在实验室中都是保存在零下80°的冰箱中，可以保存1-2年。
其实，实验过程真的很脏，如果要基因扩曾，其过程不可避免要培养大肠杆菌。有很多专家担心，植物进化或植物突变后，会把携带的转入基因变成伤害基因，表达的蛋白有问题，所以转基因安全就经常被大家提到。
例 如转基因大豆，为了得到高产抗倒伏，抗病虫害，抗旱抗寒的优良品种，可能要向大豆中转入不同植物的或动物的基因，这些基因很多都是不稳定的，植物也是很聪明的，它能够识别异己，不是自己的就剪切掉，或者蛋白质不表达，所以品种的抗性就失去了，这是转基因实验中经常出现的问题。
其实非转基因的豆油比转基因的便宜，大家自己想想为什么吧，不说贵的就好，但是贵是有原因的，人类吃了百年的自然地植物油没有问题，不好处吃了转基因的就没有问题，这些只有经过实践和时间的验证才知道啊。