本是一家人，究竟是什么原因导致二人反目成仇，以至于在马季去世之后，侯耀文第一个跳出来反对媒体将马季称为大师的说法。
马季侯耀文二人为何会有矛盾？要说马季和侯耀文的矛盾争端，大概就是从劫难开始。传闻马季曾经打过侯宝林一巴掌，这件事在相声界自然是讳莫如深，甚至谈之色变。在节目《以德服人》中，郭德纲和马季就曾探讨过这个问题。郭德纲说：对这件事，专门问过师父和二大爷，但两人都予以否认。
马东解释说：自己的父亲马季懒得去解释这些，也就使得传闻逐渐肆虐，一直到去世，也没有解决这个问题；黄宏的父亲黄枫写过一个证明，如果需要的时候会拿出来证明清白。
是真是假早已说不清，但可以确定师徒二人多年后才和解，并且两人的说法都很含糊，才使得传闻一直传播。二代的恩怨并不是这一件事就可以招致的，这里就要提到一个爆料。
浩劫时马季写了一段相声。叫《训候记》；浩劫之后，候宝林也写了一段相声，叫做《训马记》，不知道大家有没有听过这个故事。
说明一下，这件事情并未证其真假，也全当作一个笑话来看。估计马季先生不会做这样的事情，后面的新段子也就没有可实施性了。
再有马季对马三立的态度问题，根本还是送的那一副字：前无古人，后无来者。马家和侯家的关系也是不好言说，中间也有隔阂，一件事就可以证明——侯宝林去世之后，都没有告诉马三立。这是考虑马三立身体不好，不适合舟车劳顿？如此一来，必然招致侯耀文的不满，因此也使得矛盾进一步深化。
还有一点原因，侯耀文看不上马季，马季鄙夷侯耀文。马季不让自己的儿子马东进入相声行业的一个重要原因，就是这个行业太丑恶，这也是马季向马三立靠拢的一个原因。
马季年轻时在侯家学艺，没少受过侯耀文的欺负。老话讲主有多大，奴就有多大，何况又是亲生儿子呢，侯耀文从小就对父亲的这些徒弟不太在乎，这种习惯一直延续到他成年成名以后，算是生于侯门死于张狂。
马季只能暗暗撒气，人在屋檐下，不得不低头。只希望自己快快成名，不再受气。这也就是后来北京相声分化成马、侯两派的原因。马季也时时教育马东不能因为你爸爸是谁就目中无人，逢事逢人莫张狂别嘚瑟。这种教育方式也暗暗影响了郭德纲，由郭麒麟的家教可以例证。
其实候宝林在世后期已经开始打压马季了，而马季碍于情面并未吭声，而这种打压一直持续，侯门父子的强势应该都懂。
而侯家要是没有侯耀文后来收郭德纲为徒，那真是可以算是相声圈的“罪人”了因此现在有好多人说，侯耀文的唯一贡献就是收了这个徒弟。