波妞是一条生活在海底的小美人鱼。她总想溜出去看看外面。当她来到海边时,波妞不小心被塞进了一个玻璃瓶里。幸好宗介找到了波妞,救了她,把她放在一个绿色的小桶里。起初宗介以为波妞是一条小金鱼,后来她发现波妞是一条神奇的小鱼。宗介是一个非常负责任的小男孩。从他救了波妞的那一刻起。
宗介对波妞很好,波妞也很喜欢宗介,甚至学会了和宗介说话和表白。但是波妞的父亲是个魔术师,他不希望波妞和人类接触,就把波妞带回了海底。但是波妞喜欢宗介,想和宗介在一起,变成人。虽然波妞的父亲用魔法压制了她,但波妞最终还是因为舔宗介的血和父亲生命之水的作用离家出走了。
波妞和宗介历尽千辛万苦,终于说服波妞的父亲让她和宗介在一起。很多人认为他们之间有一段友谊,是宫崎骏其人讲的爱情故事,但是小孩子的爱情比大人的要美好得多,所以他们采用了小孩子的形象给你讲这样一个温暖美好的故事,这是爱情最纯粹的样子。